longue journée !

Yo a tous !

Tout a l'heure au labo j'avais commencé un petit message, ca debutait par "hey, 17h et je suis encore au labo ! vous y croyez ... ! ", j'ai été interrompu et du coup j'ai pas pu finir mon message !

Finalement je suis parti il etait 19h15 !

aujourd'hui le boss du lab etait la, du coup pas question de flemmarder, ou en tout cas pas trop !
ce matin j'ai .... hmmm, attention terme scientifique en vue, tous aux abris.
donc ce matin, j'ai fait des primers qui me serviront a faire une PCR en vue de sequencer un gene pour trouver pourquoi il deconne le petit !
ouch ! dur hein ... et encore je vous avait prevenu, c'est pas comme si je vous avait pris en traitre en vous balancant des mots compliques ... genre paf Western blot, mini prep, Caenorhabditis Elegans ..... dur dur !
Bon, bref, j'explique un peu, si vous etes déjà familier avec tout ca, passez quelques lignes :)
le mot le plus important la dedans c'est "PCR", ca signifie Polymerase Chain Reaction ! c'est une sorte d'experience un peu compliqué dont le but est finalement assez bidon, recopier de l'ADN, et en faire plein de copie identique. Pour votre culture générale, sachez que c'est une des experience de base de la biologie moléculaire.
Donc, pour faire ma PCR, j'ai besoin de plusieurs trucs dont des "primers" ou "amorces" en francais ! j'ai pas envie de trop vous saouler avec mes machins scientifique, donc je vais faire simple, disons que ca permet d'amorcer la reaction, et donc pour faire ces primers, il faut connaitre un peu la séquence qu'on veut recopier, en tout cas il faut connaitre chaque bout !
petit exemple basique :
j'ai une sequence : attttattgttactaactggctaataatatatagctcgatatcggctcgatc

voila, donc j'ai ma séquence que je veux recopier, et il faut choisir des morceaux de séquences qui servent d'amorces pour recopier la séquence en blanc. voila c'est ca que j'ai fait ce matin, sauf que la séquence que j'avais a la base etait un tit peu plus grande. allez voir là pour voir un peu a quoi je me frotte, et encore me semble que la sequence que j'avais etait un peu plus grande :)
Mais bon, je vous rassure, on veut pas recopier tout ca, juste des morceaux a droite a gauche ! ( enfin je sais pas si ca vous a rassuré ... ! tant pis :P )
On pourrait croire que ca a rien de compliqué ! mais ya plein de choses a prendre en compte, par exemple pour sequencer, on peut sequencer que 800 bases après l'amorce, et souvent ce qu'on veut c'est plus grand ! et il faut pas prendre n'importe quelles amorces, il faut qu'elles aient un pourcentage de bases "G et C" assez haut, sinon ca deconne ! bref, j'ai passé a peu près 2h a m'acharner a trouver des foutus amorces, belle prise de tete !

Ah, une petite image de la bestiole sur laquelle je travaille ...après le "tueur de souris " on va m'appeller "l'eleveur de vers" je paris !
encore la il y en a qu'un, et les petites boules au dessus, ce sont des oeufs qui n'ont pas éclos ! :)
si j'ai l'occasion de prendre des photos je vous montrerai ce qu'on voit vraiment sur les plaques sous le microscope ... yen a des milliers comme ca, qui grouillent et tout ! haha, ca doit en degouter certaines ! mais je vous rassure, quand c'est adulte, ca doit faire genre 1mm de long maximum ( et encore pour les plus grand ), on les voit a peine a l'oeil nu, avec une bonne lumiere on peut les voir, mais c'est chaud !

Je suis en train de me dire que je ferais bien un blog "la bio pour les nuls", histoire d'expliquer un peu plus en detail tout ce dont je parle ... enfin pour vous expliquer un peu comment ca marche tout ca, l'ADN, l'ARN, les proteines, les genes ! j'ai peur de pas interesser grand monde ... !
on verra bien vos reactions !

donc après avoir terminé mon histoire de primers, j'ai été mangé un morceau, puis j'ai fait une petite PCR avec d'autres primers qu'ils avaient déjà.
resultat demain matin.

A 17h tous les jeudis, c'est Happy Hour au Skirball Institute !
apparemment tous les jeudis un labo est chargé d'organiser un petit gouter a 17h, et tout le monde est libre de venir manger un morceau !
C'est d'ailleurs pour ca que j'ai été coupé tout a l'heure en ecrivant mon message.
je m'attendais a trouver des trucs genre Donuts, Bagles etc .... ben non, Pizza et Biere :D les americains me feront toujours halluciner !
donc hop, on s'est mangé tout ca, j'ai retrouvé mes collegues francais du Skirball pendant qu'on mangeais !
Je ne sais toujours pas le nom d'une des filles qui bosse avec moi ! c'est assez frustrant, j'ose pas lui demander ! c'est une des personnes qui prend le plus la peine de me parler ( j'suis pas hyper causant encore ! ) et je me voit mal lui redemander son prenom alors que je connais ceux des autres ! mais je crois qu'il est ecrit sur une sorte d'organigramme a coté des ascenseurs ! mais chaque fois j'oublie de regarder !
demain matin Lab Meeting ! a 10h dans la salle de conference. je sais pas qui va parler, on verra bien. je vais sans doute pas comprendre la moitié de ce qu'on va raconter comme l'année derniere ... maisbon ! ca peut etre marrant ! d'ailleurs ya petit dèj gratuit a chaque fois, ca c'est bien !
l'americain moyen doit faire au moins 25 repas par jour, je sais pas comment ils font ! tu m'etonne qu'ils aient des problemes d'obésité !

ah, fait interessant aussi ... ce matin il neigeais ! pas le gros flocon canadien, plutot le petit flocon maigrichon somalien qui ferai pas de mal a une mouche ! bon, ca a sans doute pas duré longtemps ! mais assez pour que j'en prenne un peu sur la tete entre le metro et le boulot :)

Tiens d'ailleurs, parlant de mouche et de pluie ... question !
ca m'est passé par la tete a l'instant, c'est sans doute une reflexion un peu simpliste, mais qui merite d'etre réfléchie ... !
imaginons, un moucheron qui vole .... et la tout d'un coup il se met a pleuvoir !
le moucheron quand il se prend des gouttes d'eau ... parce que je le sens pas capable de les eviter a mesure qu'elles tombent ! donc le moucheron, il lui arrive quoi ?
il passe a travers l'eau ?
il se fait emporter par la goutte jusqu'au sol, et il explose tout comme la goutte en arrivant au sol ?
il est prisonnier de la goutte et il se noit ?
il sort son parapluie ?
.... autre ( precisez ! )

sur cette interrogation, je vous salue bien bas !
Biz